Abstract: The Andes Mountains particularly the forests along the mid-elevations of their eastern and western slopes, are a hotspot of biodiversity (high numbers of species and endemics). Among mammals, rodents are a priority group for study in the Tropical Andes given their high diversity and often relatively small geographic ranges. Here, we use DNA barcoding as a tool to help in the identification, and preliminary analysis of the phylogenetic relationships, of rodents from two natural reserves: Otonga, a private forest reserve, located on the western slopes, and Sangay National Park, located on the eastern slopes of the Ecuadorian Andes. We sequenced 657 bp of the mitochondrial Cytochrome Oxidase I (COI) gene for 201 tissue samples of sigmodontine and echimyid rodents collected primarily in Otonga and Sangay. We conducted phylogenetic analyses using maximum-likelihood and Poisson tree processes (PTP) species delimitation analyses. Three sets of data were analyzed: 1) our newly generated sequences, 2) our Mesomys sequence plus DNA sequences of Echimyidae available in GenBank, and 3) all of our sequences (all Sigmodontinae and one Echimyidae) together with relevant DNA sequences of Sigmodontinae available in GenBank. Our samples consisted of 24 species; the molecular data indicated that only one species—Microryzomys minutus—was shared between both eastern and western localities. Contrary to the currently recognized distributions of Akodon mollis and Chilomys instans, our species delimitation analysis suggests that these species are not shared between Otonga and Sangay, and may actually represent two species each. The sample of Mesomys from the eastern slopes of the Andes differs minimally from that from the lowlands of the Ecuadorian Amazon, suggesting that both populations would correspond to the same species, Mesomys hispidus. Both Mindomys hammondi and an undescribed Mindomys from Otonga do not form a reciprocally monophyletic group with relation to Nephelomys. The Nephelomys of Sangay might correspond to two different species. The eastern and western slopes of the Tropical Andes harbor different species of rodents, with only one of our study species shared between both localities, implying that other cases of shared species between the eastern and the western slopes of the Andes need further assessment. Several lineages represented in our sample may require formal taxonomic description, highlighting the need for further systematic research. The new genetic data generated in our study could speed taxonomic discovery in the Andes and help to illuminate interesting evolutionary patterns, such as the radiation of Thomasomys.

Resumen: Los Andes particularmente los bosques de las elevaciones medias de las estribaciones occidentales y orientales, son un punto caliente de biodiversidad (alto número de especies y de endemismo). Entre los mamíferos andinos, los roedores son un grupo prioritario a ser estudiado dada su alta biodiversidad y sus rangos de distribución que por lo general son pequeños. En esta contribución, usamos códigos de barras de ADN como una herramienta para la identificación y generación de hipótesis filogenéticas preliminares de los roedores colectados principalmente en dos reservas naturales: Otonga, ubicada en las estribaciones occidentales, y Sangay, localizada en las estribaciones orientales de los Andes ecuatorianos. Secuenciamos 657 pares de base del gen mitocondrial Citocromo Oxidasa I (COI) en 201 muestras de tejido de roedores sigmodontinos y echimyidos colectados principalmente en Otonga y Sangay. Hicimos análisis filogenéticos usando máxima verosimilitud, y análisis de delimitación de especies mediante el proceso de árboles de Poisson (PTP). Tres grupos de datos fueron analizados: 1) todas nuestras nuevas secuencias generadas, 2) nuestra secuencia de Mesomys más las secuencias de ADN de Echimiydae disponibles en GenBank, y 3) todas nuestras secuencias (mayoritariamente Sigmodontinae) junto con secuencias de ADN de Sigmodontinae disponibles en GenBank. Nuestra muestra contiene 24 especies; los datos moleculares demuestran que solo una especie—Microryzomys minutus—es compartida entre ambas localidades del este y oeste. Mientras que nuestro análisis de delimitación de especies sugiere que Akodon mollis y Chilomys instans no son compartidas entre Otonga y Sangay, y representan dos especies cada una. La muestra de Mesomys de la vertiente oriental de los Andes es mínimamente diferente de secuencias de las tierras bajas de la Amazonia ecuatoriana; recomendando que ambas poblaciones podrían corresponder a la misma especie, Mesomys hispidus. Mindomys hammondi y una especie no descrita de Mindomys de Otonga no forman un grupo monofilético en relación a Nephelomys. Los Nephelomys de Sangay corresponderían a dos especies diferentes. Las vertientes occidental y oriental de los Andes tropicales albergan especies diferentes de roedores, con una sola especie compartida entre ambas indicando que otros casos de especies compartidas entre el este y occidente necesitan ser investigadas con mayor detalle. Múltiples especies de nuestra muestra necesitarían descripción formal, lo que revela que se requiere más investigación sistemática en la región. Los nuevos datos genéticos aquí presentados podrían acelerar los descubrimientos taxonómicos en los Andes y ayudar a explorar patrones volutivos interesantes, como la radiación de los Thomasomys.

OBJECTIVE: MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that regulate gene expression at the posttranscriptional level. Some miRNAs, including let-7a and miR-195, have been described as tumor suppressors. However, the roles of these microRNAs in breast cancer progression remain controversial. The aim of this study is to evaluate miR-195 and let-7a expression as potential biomarkers of invasive breast cancer. METHODS: In the present study, 200 individuals were separated into three groups: (i) 72 women constituting the control group who were selected according to rigorous and well-established criteria; (ii) 56 patients with benign breast tumors; and (iii) 72 patients with malignant breast cancers of different clinical stages. The miR-195 and let-7a expression levels in serum were evaluated by real-time PCR. The results were assessed alone and in combination, and the analysis included an estimation of sensitivity and specificity in ROC curves. RESULTS: Compared with the benign and control groups, both microRNAs were downregulated in the malignant breast cancer patient group. Compared with the malignant group, the combination of both biomarkers in the control and benign groups showed good sensitivity and specificity in the serum with AUCs of 0.75 and 0.72, respectively. The biomarker combination for the control group versus the malignant group exhibited a better sensitivity and specificity than for the benign group versus the malignant group. CONCLUSION: These findings support the evidence that the analysis of miR-195 and let-7a can be used as a non-invasive biomarker for breast cancer detection.

Com a realização deste trabalho, avaliou-se a qualidade física, química e bioquímica do percolado produzido em colunas de resíduo sólido urbano recém-coletado (RSU), contendo ou não camada de resíduo de construção civil (RCC), com fins de aproveitamento agrícola; para isso, o RSU foi colocado, de forma seqüencial em camadas de 0,15 m de espessura e peso específico de 7 kN m-3, obtidas por compressão do material acondicionado, formando-se ao final duas colunas com 2,47 m de altura. Em uma das colunas, antes do acondicionamento do RSU, foi disposta uma camada de 0,30 m de RCC, como base para a coluna. Amostras do percolado lixiviado das colunas foram coletadas quinzenalmente para a realização das seguintes caracterizações: CE, pH, ST, SST, DQO, DBO, N total, Ca, Mg, Fe, Mn, Cd, Cu, Zn, Pb, Ni e Cr. Com base nos relativamente altos valores de pH e de concentrações de material orgânico e macronutrientes (N, Ca, Mg) e de baixas concentrações de metais pesados, o uso dos percolados de aterros sanitários deve ser considerado como forma viável de disposição final dessa água residuária.

This study aimed to evaluate the physical, chemical and biochemical characteristics of the percolate produced by recently collected solid residue (RSU) columns with or without residue layer from building demolition (RCC). For this, the RSU was sequentially conditioned in layers of 0.15 m and 7 kN m-3 density to obtain two columns of 2.47 m height. One of the columns received a RCC 0.30 cm layer, positioned at its base. Samples of the leachate were collected every fifteen days for the following characterization: pH, EC and concentration of TS, TSS, COD, BOD, total N, Ca, Mg, Fe, Mn, Cd, Cu, Zn, Pb, Ni and Cr. The presence of the RCC layer in the columns provided no alterations in EC, but caused a decrease in concentrations of BOD, COD, TOC, TS, TSS, Ca, Mn and Fe in the leachate. Based on high values of pH, organic matter and macronutrient concentrations (N, Ca and Mg) and low concentrations of heavy metals, the landfill leachate for fertirrigation must be considered as a viable form of final disposal of this wastewater.

Comparamos os efeitos da degradação ambiental sobre a ecologia alimentar de duas populações de Tropidurus torquatus (Wied, 1820) em áreas de restinga da Ilha da Marambaia, sudeste do Brasil. Ambas as populações apresentaram dieta relativamente diversa e deferiram em número (D Max = 0,22; DF = 2; p = 0,00) e volume de presas consumidas (D Max = 0,82; DF = 2; p = 0,00). Formigas foram os itens mais freqüentes e numerosos em ambas as áreas, e material vegetal e coleópteros os mais importantes em volume. A população da área perturbada apresentou maior largura de nicho alimentar para número de presas consumidas (Bi num = 3,06) e volume (Bi vol = 2,98), quando comparada à outra população (Bj num = 2,44; Bj vol = 1,52). A sobreposição de nicho foi mais marcante para o número de itens consumidos entre as populações (Oij num = 0,82) e menos marcante para volume (Oij vol = 0,05). Nossos dados sugerem diferenças nas dietas entre as duas populações de lagartos, e estas diferenças parecem estar associadas à degradação ambiental. Nossa principal hipótese para explicar as diferenças nas dietas embasa-se na Teoria do Forrageamento Ótimo. Entretanto, o comportamento alimentar, e conseqüentemente a dieta dos lagartos, mostrarem-se limitadas filogeneticamente, com um padrão que pode ter evoluído no ancestral de todos os iguanídeos.

We compared the effects of habitat disturbance on the feeding ecology of two local populations of Tropidurus torquatus (Wied, 1820) in restinga habitats on Ilha da Marambaia, Southeastern Brazil. Both populations presented a relatively diverse diet and differ in the number (D Max = 0.22, DF = 2, p = 0.00) and volume of prey consumed (D Max = 0.82, DF = 2, p = 0.00). Ants were the most frequent and numerous preys in both areas, and plant matter and coleopterans were the most important alimentary items in volume. The population from the disturbed area presented a larger niche breadth for number of prey items consumed (Bi num = 3.06) and volume (Bi vol = 2.98), when compared to the other population (Bj num = 2.44, Bj vol = 1.52). Niche overlap was higher for number of items consumed between the populations (Oij num = 0.82) but lower for volume (Oij vol = 0.05). Our data suggest dietary differences between the two lizard populations, and these differences may be associated with environmental modifications. Our main hypothesis to explain the dietary differences is based in the Optimal Foraging Theory. However, the alimentary behavior, and consequently the diet of these lizards, seems to be constrained phylogenetically, with a pattern that may have evolved in the ancestor of all iguanids.

Em áreas de restinga da Marambaia, Rio de Janeiro, foram registradas nove espécies de lagartos, pertencentes a quatro famílias. A análise morfométrica sugeriu um padrão de estruturação por invasão, com dois grupos distintos de espécies compondo a comunidade: os "corredores de chão", formado pelos animais de corpo mais robusto e membros mais longos, representados por Tropidurus torquatus (Wied, 1820), Ameiva ameiva (Linnaeus, 1758), Liolaemus lutzae Mertens, 1938,Cnemidophorus littoralis Rocha, Araujo, Vrcibradic & Costa, 2000 e Tupinambis merianae (Duméril & Bibron, 1839); e os "escondedores", reunindo lagartos de menor tamanho e membros mais curtos, representados por Hemidactylus mabouia (Moreau de Jonnès, 1818), Gymnodactylus darwinii (Gray, 1845), Mabuya agilis (Raddi, 1823) e M. macrorhyncha Hoge, 1947. As relações morfométricas dentro da comunidade de lagartos de restinga da Marambaia espelham a influência da estrutura física do habitat (habitat estrutural): a disponibilidade de bromélias e de outros locais para esconder, importantes para os lagartos "escondedores", assim como a distribuição de áreas abertas para os "corredores de chão". Nossos resultados também indicam que as restingas apresentam "espaços ecomorfológicos" disponíveis (nichos vagos) para ocupação por espécies adicionais de lagartos.

In restinga areas of Marambaia, Rio de Janeiro, we recorded nine species of lizards, grouped in four families. The morphometric analysis suggested an invasion-structured pattern, with two distinct groups of species in the community: the "ground-runners", composed of animals with robust bodies and long limbs, represented by Tropidurus torquatus (Wied, 1820), Ameiva ameiva (Linnaeus, 1758), Liolaemus lutzae Mertens, 1938, Cnemidophorus littoralis Rocha, Araujo, Vrcibradic & Costa, 2000 and Tupinambis merianae (Duméril & Bibron, 1839); and the "hiders", composed of small-bodied animals with short limbs, represented by Hemidactylus mabouia (Moreau de Jonnès, 1818), Gymnodactylus darwinii (Gray, 1845), Mabuya agilis (Raddi, 1823) and M. macrorhyncha Hoge, 1947. The morphological relationships within the restinga lizard community reflect the influence of the habitat physical structure: bromeliad availability and other refugia, used by the "hiders", and the distribution of open areas, used by the "ground-runners". Our results also indicate that the restingas hold "ecomorphological spaces" (vacant niches) available for occupation by additional lizard species.

Estudaram-se os padrões de parasitismo por larvas de Eutrombicula alfreddugesi (Oudemans, 1910) em três espécies de Tropidurus Wied, 1820 do Cerrado brasileiro: T. oreadicus Rodrigues, 1987 (n = 97), T. itambere (n = 85) e T. torquatus (Wied, 1820) (duas amostras n = 75, n = 23). A maior prevalência foi observada em T. itambere Rodrigues, 1987 (88,2%), seguido por T. oreadicus (87,6%) e T. torquatus (17,3% e 65,2%). Os sítios de infestação mais importantes foram as bolsas de ácaro e dobras de pele, em especial do pescoço e região inguinal. Tropidurus itambere foi a espécie mais intensamente parasitada (intensidade média de infestação: 36,67 ± 41,09), seguido por T. oreadicus (15,38 ± 21,08) e T. torquatus de Unaí, Minas Gerais (12,13 ± 21,09). A intensidade parasitária mais baixa foi registrada para os indivíduos de T. torquatus oriundos de áreas urbanas e periurbanas de Brasília, Distrito Federal (1,97 ± 5,43). As analises não indicaram diferenças nas intensidades parasitárias entre os sexos para nenhuma das espécies. As diferenças no padrão de parasitismo entre as três espécies de lagartos podem estar relacionadas a variações morfológicas e numéricas das dobras de pele (em especial das bolsas de ácaro), ao grau de conservação do hábitat dos hospedeiros, a processos seletivos relacionados à redução de danos ao corpo dos hospedeiros, à evolução de mecanismos de diminuição da transmissão de doenças por parasitas, ou até mesmo a aspectos comportamentais dos lagartos.

This study concerns the patterns of parasitism by the larvae of Eutrombicula alfreddugesi (Oudemans, 1910) on three species of Tropidurus Wied, 1820 from Cerrado habitats of Central Brazil: T. oreadicus Rodrigues, 1987 (n = 97), T. itambere (n = 85) and T. torquatus (Wied, 1820) (two samples n = 75, n = 23). The highest prevalence value was observed in T. itambere (88.2%), followed by T. oreadicus (87.6%), and T. torquatus (17.3% and 65.2%). The most important sites of infestation were the mite pockets and skin folds, especially on the neck and inguinal region. Tropidurus itambere Rodrigues, 1987 was the most heavily parasitized species (mean intensity of infestation: 36.67 ± 41.09), followed by T. oreadicus (15.38 ± 21.08), and T. torquatus from Unaí, Minas Gerais (12.13 ± 21.09). The lowest intensity of infestation was found in T. torquatus from urban and periurban areas of Brasília, Distrito Federal (1.97 ± 5.43). The analysis did not indicate differences in intensity of infestation between sexes for any of the species. Differences in the patterns of parasitism among the three lizard species may be related to the morphological and numerical variation of the skin folds (especially mite pockets), to the degree of conservation of the host's habitats, and to selective processes related to reduction of damage to the host's bodies, to the evolution of mechanisms of decreasing illness transmission by parasites, or even to some behavioral traits of the lizards.

OBJETIVOS: Os sarcomas sinoviais são tumores raros e agressivos que acometem adultos jovens, com sobrevida doençaespecífica em cinco anos de 57 a 63%. O presente estudo analisa a experiência institucional com este tumor, dando ênfase à associação entre variáveis clínicas, padrões de recorrência e sobrevida. MÉTODO: Entre 1970 e 2001 foram identificados 57 pacientes com sarcomas sinoviais. Fatores demográficos, clínicos e anatomopatológicos foram pesquisados. Associações entre variáveis clínicas e a sobrevida livre de recidiva local, livre de metástases e doença-específica em cinco anos foram calculadas. RESULTADOS: A idade mediana dos pacientes foi 26 anos, 56% eram masculinos, 79% eram brancos. Localizavam-se em membro inferior em 74%, proximalmente em 53%. O sintoma mais comum foi a presença de tumor em 42%. Na admissão 18% eram intactos, 42% manipulados e 40% recidivados. A maioria era maior que 5 cm., e três pacientes apresentavam metástase linfonodal. A cirurgia mais freqüente foi ressecção ampla, 30% necessitou amputação. Margens amplas foram obtidas em 65%, 51% eram tumores bifásicos. Neoadjuvância foi utilizada em 46% e adjuvância em 58% dos casos. As sobrevidas livre de recidiva local , metástases e doença específica em cinco anos foram 60±8%, 47±7% e 58±7%. A localização proximal do tumor associou-se com preservação de membro (p=-0,001), margens inadequadas (p=0,006) e subtipo bifásico (p=0,047). CONCLUSÕES: Os dados confirmam a hipótese de tratar-se de tumor agressivo, com altos índices de recidiva local e à distância. Os resultados do tratamento são comparáveis a outros centros especializados. Tratamento fora destes centros deve ser desencorajado.

BACKGROUND: Synovial sarcoma is a rare and aggressive tumor more frequently affecting young adults and has a 5 year disease specific survival of 57-63%. The present study describes the institutional experience with the treatment of this tumor, emphasizing associations between clinical variables, patterns of recurrence and survival. METHODS: Between 1970 and 2001, 57 patients were identified with synovial sarcomas. Demographic, clinical and histological factors were analyzed. Associations between clinical variables and 5 year local recurrence free, metastasis free and disease specific survival were calculated. RESULTS: Median patient age was 26 years, 56% were male and 79% caucasians. Tumors were located in the lower limb in 74%, proximally in 53%.The most common symptom was the presence of tumor in 42%. At admission, 18% were intact, 42% manipulated and 40% recurrent. Most of them were larger than 5 cm, 3 patients had lymph node metastasis. The most common procedure was extensive resection, 30% were amputated. Wide margins were obtained in 65%, 51% were biphasic tumors. Neoadjuvant therapy was performed in 46%, 56% had adjuvant therapy. The 5 year local recurrence free, metastasis free and disease specific survival were 60±8%, 47±7% e 58±7%. Proximal location was associated with limb sparing procedures (p=0.001), close margins (p=0.006) and biphasic tumors (p=0.047). CONCLUSION: Data support the hypothesis that this is an aggressive tumor, with high rates of local and remote recurrences. The survival obtained was comparable to other reference centers. Treatment outside these centers should be discouraged.